故事发生在遥远的未来，彼时，地球已经被人类所制造的侵蚀破坏殆尽，更有侵蚀产生了邪恶怪兽横行占领了人类的生存空间。无奈之下，人类只能移居到了拥有独立神智的“自律型移动都市”之中，而这些都市之间，则为了争夺少之又少的资源而展开了激烈的争斗。在学院都市洁儿尼中发生了一场骚乱，刚刚入学就读于普通教育系的新生雷冯（冈本信彦配音）在混乱之中展现了自己出色的应变和战斗的能力，因此被学生会长发掘，转入了武技系，更获得了加入都市护卫第十七小队的资格。外冷内热沉默寡言的菲丽、恪尽职守坚韧强悍的妮娜、个性轻浮但十分可靠的夏尼德，这些奋战在前线的伙伴们，为了守护他们赖以生存的都市，甘愿付出血的代价。豆瓣在污染大地上，雷冯保护谁呢在遥远的时间尽头。世界被大规模“污染物质”覆盖后，大地被新的主宰污染兽所占领。人类无法居住的荒野被称为“污染兽”的异形怪物所占据，人类在拥有独立意识及功能的“自律型移动都市”中生活。赌上各自的存亡，都市与都市之间被操控着进行战争。还有能够覆盖天地的巨大怪物“污染兽”群。少年少女们为了保护自己的都市，使用超能力“剄”不断进行战斗。故事就发生在无数“移动都市”中的其中一个“学院都市切尔尼”，少年雷弗在新生入学仪式上在与其他学院的学生引发的